День памяти обретения мощей преподобного Арсения Коневского молитвенно встретили на петербургском подворье монастыря. Накануне, 27 мая, было совершено Всенощное бдение, 28 мая — Божественная литургия. Богослужения совершил иерей Максим Василюк.
В 1991 году остров Коневец и монастырские постройки были переданы государством Санкт-Петербургской епархии. В феврале 1991 года митрополит Санкт-Петербургский и Ладожский Иоанн (Снычев) назначил наместником монастыря архимандрита Назария (Лавриненко). Спустя более пятидесяти лет после того, как коневская братия, спасаясь от войны, покинула остров, новые молитвенники продолжили монашескую традицию.
В том же году были обретены мощи преподобного Арсения, чудесным образом сохранившиеся под полом храма. Экспертиза мощей, подтвердившая их подлинность, была проведена в 1998 году. Впоследствии для них была устроена резная рака.
17 марта 2016 года совершилось историческое событие для Выборгской епархии и всей Русской Православной Церкви. По благословению святейшего Патриарха Московского и Всея Руси Кирилла установлен день празднования обретения мощей преподобного Арсения Коневского 28 мая.